本发明涉及一种分子筛催化剂及其制备方法和应用。分子筛催化剂的制备方法包括以下步骤:将碱源、铝源、硅源及模板剂依次加入去离子水中,搅拌,形成均匀溶液;缓慢加入C1‑C4的醇类,继续搅拌,形成溶胶液;对所述溶胶液在水热条件下进行晶化,经过滤、干燥、焙烧,得到钠型分子筛原粉;将所述钠型分子筛原粉与铵盐溶液或稀盐酸进行离子交换,经过滤、干燥,得到氢型分子筛原粉;将所述氢型分子筛原粉、粘结剂及适量水混合后进行挤压成型,经干燥、焙烧,得到分子筛催化剂。该制备方法制备的分子筛催化剂能够解决催化剂存在的积炭失活快、寿命短和正丁烯骨架异构化制备异丁烯的过程中副反应严重等问题。